國務院直屬機構,是國務院設立的主辦各項專門業務的機關。如海關總署、稅務總局、工商總局、質檢總局、體育總局、安全監管總局、食品藥品監管總局等。國務院國有資產監督管理委員會是國務院直屬特設機構。
《國務院行政機構設置和編制管理條例》第六條規定,「國務院行政機構根據職能分為國務院辦公廳、國務院組成部門、國務院直屬機構、國務院辦事機構、國務院組成部門管理的國家行政機構和國務院議事協調機構」;「國務院直屬機構主管國務院的某項專門業務,具有獨立的行政管理職能」。